More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4078 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  94.23 
 
 
416 aa  761    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  826    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  58.78 
 
 
414 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  49.09 
 
 
400 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
414 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  26.16 
 
 
404 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  26.74 
 
 
404 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  26.32 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.81 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.74 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  26.5 
 
 
416 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  28.72 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  23.74 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  23.74 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.67 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.25 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  26.58 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  22.1 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  26.61 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  24.19 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  24.19 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  24.19 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  24.19 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  24.19 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  25.4 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  24.47 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  24.73 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  23.06 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  26.29 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.81 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.35 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.63 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.89 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  27.35 
 
 
487 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.62 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  21.77 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.68 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.75 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  35.71 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  21.43 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  22.01 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.32 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  22.46 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.24 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 
425 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.06 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  25.5 
 
 
419 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  35.83 
 
 
473 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  24.87 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  25.38 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  28.36 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  29.63 
 
 
405 aa  60.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 
424 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
480 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.32 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.35 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.57 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  21.21 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.57 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.83 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25.38 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.83 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  27.06 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  24.51 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.06 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.75 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  26.72 
 
 
436 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.63 
 
 
405 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.29 
 
 
396 aa  57.4  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 
480 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.13 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>