More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1265 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  90.32 
 
 
408 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  90.32 
 
 
408 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  99.75 
 
 
404 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  100 
 
 
404 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  90.32 
 
 
408 aa  697    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  90.32 
 
 
408 aa  697    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  99.75 
 
 
404 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  90.32 
 
 
408 aa  697    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  99.5 
 
 
404 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  90.1 
 
 
409 aa  693    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  99.26 
 
 
404 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  82.46 
 
 
411 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  90.07 
 
 
408 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  61.58 
 
 
410 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  61.15 
 
 
406 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  60.71 
 
 
397 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  61.64 
 
 
397 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  60.26 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  61.32 
 
 
403 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  61.07 
 
 
403 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  61.27 
 
 
403 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  61.07 
 
 
403 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  62.57 
 
 
400 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  48.48 
 
 
404 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  47.34 
 
 
410 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  46.32 
 
 
402 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  48.42 
 
 
411 aa  365  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  48.37 
 
 
403 aa  358  7e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  47.59 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  47.59 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  47.59 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  47.59 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  47.59 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  47.59 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  45.25 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  47.59 
 
 
404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  48.7 
 
 
404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  47.34 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  44.27 
 
 
407 aa  354  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  42.93 
 
 
404 aa  344  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  46.07 
 
 
398 aa  336  5e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 
406 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  44.99 
 
 
409 aa  327  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  43.83 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  42.2 
 
 
431 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  42.2 
 
 
487 aa  308  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 
413 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.56 
 
 
416 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  40.51 
 
 
416 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  45.67 
 
 
389 aa  296  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 
423 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  39.69 
 
 
420 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  40.94 
 
 
411 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  43.63 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  40.85 
 
 
418 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
410 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
406 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
395 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 
407 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  34.55 
 
 
394 aa  222  9e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  34.82 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  35.19 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  32.2 
 
 
401 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  36.21 
 
 
407 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
404 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  27.94 
 
 
418 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  27.94 
 
 
418 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  31.39 
 
 
450 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
389 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  30.6 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.94 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.3 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  23.51 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
425 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.26 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  23.51 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  22.97 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  24.64 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.68 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  35.1 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.32 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.32 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  24.94 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  26.23 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  26.56 
 
 
390 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.59 
 
 
416 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.03 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.64 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.35 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  26.01 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.51 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  26.23 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.75 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>