138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1279 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  813    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  97.52 
 
 
404 aa  773    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
416 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
417 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
414 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  27.85 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.51 
 
 
404 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.42 
 
 
410 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  26.21 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  21.83 
 
 
416 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  25.68 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  24.68 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.22 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  26.2 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  24.42 
 
 
404 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  23.45 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
404 aa  87  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
404 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  24.16 
 
 
404 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
404 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
404 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25.58 
 
 
403 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  23.9 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  23.14 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  22.47 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  24.81 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.96 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  23.44 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.2 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  25.99 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  25.99 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  25.99 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  25.06 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  25.99 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  25.99 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.46 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  22.89 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  22.89 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  25.93 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  22.61 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  23.04 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  23.97 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  23.12 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  23.59 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  24.73 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  25.45 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  25.5 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  24.08 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  25.5 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  25.25 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  25.5 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  23.34 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  25 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  24.54 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  22.13 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  27.49 
 
 
401 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0587  major facilitator transporter  28.49 
 
 
392 aa  56.6  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.68 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  25.65 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.56 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  20.42 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  25.18 
 
 
379 aa  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  28.21 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  32.43 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.01 
 
 
506 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  22.01 
 
 
505 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  22.01 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.01 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  33.04 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.55 
 
 
506 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1278  hypothetical protein  26.99 
 
 
386 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  19.67 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1277  hypothetical protein  26.99 
 
 
386 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  21.64 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.76 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  26.57 
 
 
469 aa  45.8  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  21.2 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>