More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1774 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 404 aa  814    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  68.69 
 
 		 407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  40.8 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  41.51 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  41.92 
 
 		 408 aa  316  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  41.67 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  41.67 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  41.67 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  41.67 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  42.2 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 397 aa  312  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  43.15 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  41.56 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  42.93 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  42.93 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  42.93 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  42.93 
 
 		 404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  43.56 
 
 		 409 aa  309  6.999999999999999e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  42.93 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  41.67 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  42.22 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  41.69 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 404 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 404 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  41.42 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  41.16 
 
 		 404 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 399 aa  265  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  35.62 
 
 		 405 aa  259  9e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 413 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  36.41 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  33.67 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.26 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 423 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  36.87 
 
 		 415 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  35.12 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  31.79 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  30.39 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  29.87 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 412 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  27.02 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.97 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.97 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.36 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  24.92 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  25.8 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  26.64 
 
 		 628 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  25.41 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  23.29 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25.08 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25.08 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25.08 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  25.26 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.19 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.19 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  27.02 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>