138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0587 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0587  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  773    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  36.78 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1114  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 395 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6951  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.39 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.58 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  23.47 
 
 		 487 aa  66.2  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  28.49 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  28.49 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.84 
 
 		 506 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  21.31 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.02 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.58 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.53 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  21.95 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  28.22 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.58 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  28.22 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  23.37 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  29.09 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  28.22 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45584  predicted protein  31.33 
 
 		 544 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  28.22 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  28.22 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  22.02 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  22.69 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  28.16 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  28.16 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  28.16 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 530 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  25.87 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  24.87 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  27.59 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  23.42 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  27.59 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  32.52 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  22.86 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0482  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 497 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  25.39 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  21.82 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  21.7 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.78 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>