30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6951 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6951  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 436 aa  816    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  32.17 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1114  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 395 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0587  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.34 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  24.65 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  22.76 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 401 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.87 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>