More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1994 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  792    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
388 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  34.83 
 
 
421 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  37.29 
 
 
404 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
381 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  32.24 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  29.72 
 
 
423 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  29.47 
 
 
423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  29.47 
 
 
423 aa  166  9e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  32.95 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
414 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  31.01 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  29.4 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  31.9 
 
 
357 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  31.7 
 
 
409 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  27.16 
 
 
403 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  28.77 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  31.41 
 
 
409 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  27.94 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  26.67 
 
 
410 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  30.37 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  30.37 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  30.37 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  25.76 
 
 
405 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.28 
 
 
423 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
385 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  25.28 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.19 
 
 
386 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  26.09 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
400 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  23.53 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  24.07 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.82 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  25.39 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  23.82 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.82 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.82 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.82 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.82 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.75 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  26.01 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  23.31 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.36 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  27.62 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  20.45 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  27.01 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  22.89 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25.77 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  22.75 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.71 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  27.7 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.21 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  24.64 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  23.1 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  23.1 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.13 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.94 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  23.41 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.94 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  22.57 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  22.54 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  25.06 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  29.38 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  26.47 
 
 
422 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  24.87 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.24 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  23.59 
 
 
409 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.95 
 
 
400 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.09 
 
 
409 aa  63.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 
476 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  34.87 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  22.69 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
530 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.98 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.17 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.3 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  28.18 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.15 
 
 
506 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.15 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.88 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>