274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6406 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  97.8 
 
 
409 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  85.33 
 
 
409 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  85.09 
 
 
409 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  85.09 
 
 
409 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  51.41 
 
 
414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  43.58 
 
 
396 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  35.43 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  33.86 
 
 
409 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  33.87 
 
 
403 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 
381 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  30.89 
 
 
410 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
388 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  31.41 
 
 
397 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  30.1 
 
 
421 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  31.25 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  26.37 
 
 
423 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.25 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.11 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.11 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  29.97 
 
 
408 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  28.49 
 
 
405 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
414 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  29.26 
 
 
410 aa  89.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
388 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  33 
 
 
357 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  37.16 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  28.12 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  34.97 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.37 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  30.11 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  24.57 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.6 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  20.7 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
463 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25.89 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.73 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
520 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  26.83 
 
 
490 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  22.44 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  28.89 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.71 
 
 
531 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  34.33 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  27.97 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
461 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 
473 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.34 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  28.24 
 
 
409 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  23.31 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
470 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  25.95 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.79 
 
 
477 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  27.6 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.32 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25.65 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  27.65 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
413 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.17 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  32.65 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.59 
 
 
405 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
507 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
400 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 
405 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  27.92 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  27.92 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.71 
 
 
405 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  27.92 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 
541 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  27.92 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
473 aa  49.7  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  21.24 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.49 
 
 
592 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  29.41 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  23.74 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23.46 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  27.92 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  29.08 
 
 
584 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  34.26 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  30.81 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  37.5 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>