73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1574 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
403 aa  781    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  41.44 
 
 
401 aa  300  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  35.54 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  33.67 
 
 
399 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  29.52 
 
 
398 aa  173  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  31.52 
 
 
383 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  30.35 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  32.18 
 
 
358 aa  138  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  27.3 
 
 
405 aa  137  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  32.9 
 
 
332 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  28.27 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
394 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
388 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
384 aa  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  26.09 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  25.49 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  26.84 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.19 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  27.16 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  23.33 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  23.62 
 
 
373 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  24.78 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  21.8 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.75 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 
391 aa  53.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  22.73 
 
 
414 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.54 
 
 
386 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  20.3 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  27.96 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  21.82 
 
 
423 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  21.82 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  21.56 
 
 
423 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  24.5 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  21.1 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  24.52 
 
 
409 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
439 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  24.54 
 
 
387 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 
383 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  27.22 
 
 
912 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  23.93 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  26.98 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.24 
 
 
895 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  21.49 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3157  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  27.27 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  24.52 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  23.68 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  25.37 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.58 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.5 
 
 
495 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.72 
 
 
498 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  27.5 
 
 
455 aa  43.5  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  22.98 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0967  major facilitator transporter  24.56 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  23.51 
 
 
403 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>