More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0790 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 388 aa  763    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  30.56 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 425 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  26.74 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.48 
 
 		 373 aa  106  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  25.47 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  23 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  25.5 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  22.9 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  25.07 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  22.74 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  23.5 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  23.24 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  22.03 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  25.41 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  30.69 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  30.86 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.94 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  30.71 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.71 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.71 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  30.71 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  22.29 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.71 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.71 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.43 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  31.82 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  28 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.23 
 
 		 737 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.39 
 
 		 1062 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  29.91 
 
 		 626 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.23 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.23 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  28.16 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.23 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.54 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.32 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.65 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  25.76 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>