92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0734 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 401 aa  791    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  41.44 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  33.9 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  32.3 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  33.05 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  30.92 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  29.64 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  30.43 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  29.69 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  30.52 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  27.62 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  26.7 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  24.08 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24.54 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  23.28 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  23.81 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  23.81 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  25.15 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 		 599 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  23.88 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  28.3 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  24.59 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  26.06 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  23.95 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  21.22 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  25.14 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  25.14 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  25.14 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  25.14 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.67 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  21.67 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.67 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  25.14 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  25.14 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  25.14 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  25.14 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.81 
 
 		 599 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  23.39 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  23.95 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.35 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.98 
 
 		 455 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  24.86 
 
 		 526 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>