282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3232 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  744    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.73 
 
 
407 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  51.16 
 
 
414 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  51.7 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  51.7 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  51.2 
 
 
410 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  50.53 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  34.63 
 
 
413 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
432 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  32.23 
 
 
414 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  32.07 
 
 
409 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  36.13 
 
 
530 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  31.82 
 
 
415 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 
412 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 
415 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  34.76 
 
 
435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
400 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  30.5 
 
 
395 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  31.23 
 
 
402 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
413 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  28.49 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.53 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  29.67 
 
 
408 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  30.77 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  30.77 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  30.5 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
397 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
408 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
414 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  30.22 
 
 
402 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  32.57 
 
 
431 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  32.01 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  28.79 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  32.3 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  28.09 
 
 
401 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.33 
 
 
405 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
459 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  30.25 
 
 
449 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
414 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  31.71 
 
 
400 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  28.06 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  30.06 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  25 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  28.42 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.34 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1203  multidrug efflux system protein MdtE  28.57 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  35.71 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
416 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  25.73 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  26.73 
 
 
466 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  26.57 
 
 
470 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2259  multidrug efflux system protein MdtE  26.57 
 
 
470 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.716187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  26.57 
 
 
470 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.33 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2475  multidrug efflux system protein MdtE  25.6 
 
 
470 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829897  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  25 
 
 
477 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  26.87 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2359  multidrug efflux system protein MdtE  26.09 
 
 
470 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 
458 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2705  multidrug efflux system protein MdtE  25.51 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  30.14 
 
 
456 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  27.43 
 
 
272 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.23 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  23.98 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.25 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  30.16 
 
 
494 aa  54.3  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6010  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
413 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  27.1 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  30.82 
 
 
411 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.98 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.67 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.89 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 
501 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 
532 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  32.11 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  29.28 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  23.2 
 
 
474 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.98 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  33.33 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.4 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  38 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  23.49 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.46 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>