239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0089 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  773    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  53.66 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  53.66 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  53.66 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  53.47 
 
 		 398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  36.45 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  36 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  35.74 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 409 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  31.94 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  32.09 
 
 		 530 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  32.21 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.53 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.41 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  29.91 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  28.46 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.69 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.65 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.65 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.65 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  32.65 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.65 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.65 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  35.59 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.65 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  30.71 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.65 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  29.23 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.97 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.97 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.97 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.97 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.97 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.68 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  33 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  29.77 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  27.36 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  27.46 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  29.77 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  27.46 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  27.36 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  27.36 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  31.72 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  31.78 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  27.36 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.68 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  27.36 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  31.72 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  30.58 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.65 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  26.89 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  26.57 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>