192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4458 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
402 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  53.51 
 
 
414 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  51.85 
 
 
395 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  52.97 
 
 
409 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  45.12 
 
 
435 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  48.3 
 
 
449 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  48.6 
 
 
412 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  46.2 
 
 
400 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  47.21 
 
 
401 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  46.61 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  44.6 
 
 
431 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 
414 aa  235  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  41.47 
 
 
415 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 
413 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  46.58 
 
 
404 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  37.86 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 
420 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 
431 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  32.63 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  31.23 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.97 
 
 
410 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.97 
 
 
410 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.97 
 
 
410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  32.78 
 
 
403 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  32.78 
 
 
403 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  32.78 
 
 
403 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.82 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  29.95 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
408 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
432 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  32.8 
 
 
398 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.29 
 
 
413 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
415 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
404 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  33.24 
 
 
400 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  31.87 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
395 aa  86.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  28.85 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.82 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  28.72 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.79 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  30.11 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.44 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  28.94 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.59 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.62 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  29.16 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  33.12 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 
527 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  25.53 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  30.07 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  28.22 
 
 
389 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  27.61 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.28 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  37.76 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  34.34 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  38.27 
 
 
550 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.8 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.8 
 
 
504 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  31.82 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.7 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  31.33 
 
 
520 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  31.82 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  38.46 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  34.65 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  31.91 
 
 
468 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1475  major facilitator transporter  38.54 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 
459 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 
483 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 
409 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 
490 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6453  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  32.86 
 
 
498 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  32.14 
 
 
453 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  32.14 
 
 
453 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 
483 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.8 
 
 
391 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 
498 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 
413 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
455 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  32.14 
 
 
472 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 
483 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  37.18 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>