195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3828 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 378 aa  683    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 423 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  37.54 
 
 		 408 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  34.91 
 
 		 423 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  34.78 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  35.69 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.75 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 415 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.88 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  34.31 
 
 		 530 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  30.64 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  30.72 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  30.42 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  31.18 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  30 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  35.11 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 		 431 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.14 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  39.6 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  39.29 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  35.24 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  38.1 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.54 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  37.08 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.85 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.85 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.41 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>