252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1662 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  759    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  61.92 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  60.62 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  47.69 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  51.85 
 
 		 402 aa  308  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  48.23 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 415 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  48.37 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 414 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 413 aa  235  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  32.28 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 414 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  32.64 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.06 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  32.64 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  32.33 
 
 		 530 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  31.65 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  29.66 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.66 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  31.55 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.91 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  26.29 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.2 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  27.3 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.78 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  34.62 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.18 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  27.42 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 464 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  29.22 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  29.41 
 
 		 471 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  32.39 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  29.31 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.97 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  28.47 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  28.57 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  26.65 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.49 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>