140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2282 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  46.67 
 
 		 414 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  48.09 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  50.57 
 
 		 431 aa  273  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 412 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 415 aa  236  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 		 420 aa  232  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 408 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.72 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  34.54 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  34.96 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  37.12 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  33.46 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.76 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  32.36 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  34.9 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  34.45 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.44 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.36 
 
 		 423 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  45.88 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  45.88 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 459 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  45.88 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.58 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.13 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.13 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.13 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.33 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  31.36 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.21 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.32 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2698  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.16 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  39.05 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  43.68 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.63 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 529 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>