217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1712 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 395 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  43.99 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  43.92 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 415 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 408 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 413 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  35.05 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.74 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.69 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  31.95 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 397 aa  93.2  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.48 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 395 aa  90.1  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  29.55 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  29.87 
 
 		 530 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  30.12 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  34.13 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.61 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  36.61 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01070  polyamine transport-related protein, putative  29.38 
 
 		 752 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.593333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  31.82 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  32 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  34.78 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.86 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  34.82 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2387  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 555 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0964642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2434  major facilitator superfamily transporter  31.5 
 
 		 555 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.356291  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2428  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 555 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  44.19 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  44.19 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  29.37 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  44.19 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 402 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  38.57 
 
 		 591 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.21 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4107  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.17 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 529 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  34.42 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>