80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3174 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  768    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  49.36 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  47.54 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  43.69 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  44.48 
 
 		 431 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 431 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.23 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.36 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  31.55 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.21 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  32.49 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  29.72 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.39 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  26.91 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.36 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 		 527 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 494 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  25.68 
 
 		 389 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  34.52 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  26.93 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  36 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1475  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.11 
 
 		 538 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  27.61 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1386  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  27.22 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.85 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  37.04 
 
 		 548 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>