120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1534 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  100 
 
 
423 aa  795    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  77.69 
 
 
408 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  63.87 
 
 
416 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  58.79 
 
 
423 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  55.5 
 
 
414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  43.92 
 
 
421 aa  246  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
413 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 
410 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  36.54 
 
 
361 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
378 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  29.62 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  29.62 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  29.37 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  29.03 
 
 
410 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  29.78 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  28.96 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  27.1 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.32 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.08 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
408 aa  77  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.12 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  30.92 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  32.43 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  27.66 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  28.49 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.43 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  35.12 
 
 
530 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  29.09 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.59 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  33.49 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  28.98 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  28.04 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  36 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  29.88 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  25 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  28.79 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  28.79 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  25.9 
 
 
389 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.06 
 
 
446 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  36 
 
 
406 aa  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
412 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  41.18 
 
 
477 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  33.82 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  40 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  27.88 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.59 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.24 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.3 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  40.3 
 
 
480 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  27.69 
 
 
400 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
402 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
420 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  30.36 
 
 
395 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
503 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.73 
 
 
391 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
431 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  38.54 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  35.56 
 
 
412 aa  46.6  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0335  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  33.79 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  38.46 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.67 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  24.64 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.27 
 
 
411 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  34.09 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.38 
 
 
405 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.27 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.29 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  40.62 
 
 
492 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.69 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  32.03 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.95 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40 
 
 
402 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  32.76 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  32.76 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  30.77 
 
 
461 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  30.77 
 
 
449 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>