134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4433 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  760    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  42.08 
 
 		 414 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 435 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  43.15 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 408 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 431 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 410 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  32.96 
 
 		 410 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.37 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  34.22 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  30.64 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  30.81 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  30.03 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  28.87 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  29.58 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  29.74 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  28.16 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  28.02 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  29.04 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 391 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.76 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1444  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.12 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  23.44 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.12 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  34.69 
 
 		 422 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.68 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2698  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.16 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  29.8 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2508  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  45.59 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.19 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  33.65 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>