154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1566 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  773    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  56.43 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  53.9 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  54.64 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  56.96 
 
 		 416 aa  319  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  45.45 
 
 		 421 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  37.89 
 
 		 361 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  35.33 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  30 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.72 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.71 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  30.79 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  26.3 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  30.49 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.48 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  32.52 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  28.37 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  24.58 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  30.98 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.9 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  30.97 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  30.97 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.54 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  27.74 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  39.82 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  27.74 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  27.74 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0335  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  27.41 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  25.24 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.92 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.34 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  27.74 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  27.1 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 		 465 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.49 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  27.74 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  37 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  27.1 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  38.04 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  27.1 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>