83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0250 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  88.64 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  63.76 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  47.68 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 395 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  45.4 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  46.2 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 414 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 397 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  32.27 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  27 
 
 		 410 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  27 
 
 		 410 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.41 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  27 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  31.35 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  27.3 
 
 		 530 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.12 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  27.65 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  27.99 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  27.84 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  24.22 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  25 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  26.39 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  35.9 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  33.33 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  28.85 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.26 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2698  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 524 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.3 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>