123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3025 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  88.94 
 
 		 414 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  60.62 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  47.72 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  52.14 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  49.71 
 
 		 401 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  49.45 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  48.09 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 431 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 431 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  36.08 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  35.96 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.94 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  28.69 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  32.1 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  30.57 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  31.16 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.04 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.82 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  27.95 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  29.06 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 461 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.68 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  47.83 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.51 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.49 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.14 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.73 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  26.9 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.03 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  29.94 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.56 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.17 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.9 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  41.18 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6453  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  27.2 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  26.4 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  42.42 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.47 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>