94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 423 aa  804    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  60.76 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  59.15 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  54.15 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  57.62 
 
 		 416 aa  339  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 413 aa  255  8e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  43.04 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  36.24 
 
 		 361 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  30.05 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.38 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.44 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.43 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  28.29 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  29.19 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  27.69 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.03 
 
 		 411 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.84 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.99 
 
 		 480 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  29.59 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.06 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  24.68 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  35 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03199  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14540)  26.89 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  35 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  35.63 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  35.71 
 
 		 561 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.58 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1080  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.235758  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02910  hexose transport-related protein, putative  33.33 
 
 		 545 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  31.51 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.07 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.7 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  27.2 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  29.41 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  34.25 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  30.08 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  29.41 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  54 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  28.57 
 
 		 628 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  33.33 
 
 		 549 aa  43.1  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  35.62 
 
 		 401 aa  43.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>