136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5114 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
403 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  771    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  86.68 
 
 
398 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  85 
 
 
400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  53.65 
 
 
408 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
412 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  33.23 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  34.19 
 
 
409 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  33.96 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  32.13 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.89 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  32.74 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  32.13 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  30.95 
 
 
395 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
413 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  29.75 
 
 
415 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  34.54 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.79 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  32.06 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  31.67 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
432 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  31.36 
 
 
412 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  31.93 
 
 
530 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  29.26 
 
 
408 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  34.13 
 
 
404 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  25.79 
 
 
410 aa  96.3  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  31.01 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  31.25 
 
 
435 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  35.06 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  25.58 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.93 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  27.16 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  25 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  26.77 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  24.05 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
459 aa  53.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  28.31 
 
 
591 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.38 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  32 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  22.92 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  26.69 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.14 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
530 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  27.91 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
424 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  32.12 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  33.11 
 
 
472 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  29.52 
 
 
398 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
397 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  29.63 
 
 
497 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  34.55 
 
 
397 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  24.58 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  29.63 
 
 
491 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
410 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  27.78 
 
 
449 aa  46.6  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.34408 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  40.98 
 
 
626 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  30.13 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  26.52 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  29.1 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.3 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.26 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
489 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.56 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  38.75 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.73 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.87 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  28 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1082  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.25 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  35.44 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  25.69 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3276  multidrug resistance protein D  49.25 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.25 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1633  hypothetical protein  25.56 
 
 
198 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  25.64 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  32.71 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
482 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
421 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  32.5 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>