109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5224 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 408 aa  767    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  77.69 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  64.87 
 
 		 416 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  60.76 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  56.43 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  43.5 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  37.36 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  31.94 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  30.08 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  30 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.7 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  32.62 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  45.59 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  35 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  25.52 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  24.14 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  44.78 
 
 		 480 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  43.62 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  43.62 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  43.62 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  35 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.86 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.02 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1080  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.235758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.34 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  43.75 
 
 		 492 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  35.71 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  35.71 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  38.24 
 
 		 536 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  35.56 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.93 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  46.88 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 529 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  34.01 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.65 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.68 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  37.67 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.13 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 474 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 243 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  29.17 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0783  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  21.84 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 272 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.19 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.69 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>