More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3364 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  100 
 
 		 407 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  48.01 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 415 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  31.45 
 
 		 530 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 408 aa  126  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.11 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  28.85 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.82 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 431 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  27.92 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  29.9 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  31.87 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  27.67 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0265  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0258  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  28 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  30.09 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  29.03 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  27.03 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.16 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 564 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 482 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 389 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 		 523 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09169  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  33.33 
 
 		 510 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0950433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 		 465 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.06 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 		 532 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  32.52 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 516 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>