46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1089 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  100 
 
 		 338 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  42.76 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  41.44 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  38.49 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 272 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.7 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  25.23 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1055  putative MFS transporter  34.12 
 
 		 116 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 412 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  25 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  23.99 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.18 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.18 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  27.74 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0849  alpha-ketoglutarate transporter  31.58 
 
 		 433 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  25.31 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 404 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 413 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  27.74 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  27.74 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  32 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  32 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  32 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  32 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 414 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  23.45 
 
 		 492 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  26.43 
 
 		 428 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  28.57 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 409 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>