190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1057 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  100 
 
 		 272 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 389 aa  236  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  53.7 
 
 		 389 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  51.36 
 
 		 389 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 338 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  33.45 
 
 		 435 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.11 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 431 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.18 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  27.45 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 428 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  38.46 
 
 		 424 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 444 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 414 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 423 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 410 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 405 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 408 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 399 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 419 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 412 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 409 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 425 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 413 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 405 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 408 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  36.56 
 
 		 399 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  36.56 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  36.56 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 397 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 398 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 403 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  25.64 
 
 		 403 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 403 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  31.78 
 
 		 414 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 428 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 426 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 396 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 427 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 410 aa  48.9  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  35.77 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  29.63 
 
 		 501 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  32.38 
 
 		 426 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  28.24 
 
 		 470 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  37.62 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 428 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.74 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 413 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  26.64 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  30.77 
 
 		 403 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 411 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  28.69 
 
 		 396 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 421 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 452 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 487 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.97 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 395 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  30.77 
 
 		 403 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.56 
 
 		 381 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  30.77 
 
 		 403 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 503 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  30.77 
 
 		 403 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.56 
 
 		 381 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  30.77 
 
 		 403 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 485 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 485 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  30.77 
 
 		 403 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.77 
 
 		 403 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  33.7 
 
 		 397 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 417 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 394 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  30.1 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 390 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  30.77 
 
 		 403 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 387 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>