More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4056 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  98.54 
 
 
410 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  773    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
410 aa  773    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  55.61 
 
 
414 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  51.44 
 
 
397 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  57.3 
 
 
404 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  49.15 
 
 
407 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 
399 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 
432 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
415 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  32.47 
 
 
415 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  30.81 
 
 
410 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
412 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
395 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  31.77 
 
 
395 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  34.15 
 
 
413 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
414 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.62 
 
 
403 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.62 
 
 
403 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
403 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  33.66 
 
 
408 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  35.73 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  31.12 
 
 
435 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  34.48 
 
 
530 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
413 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  34.62 
 
 
431 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  28.31 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
412 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 
398 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  32.5 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  31.2 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  30.66 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.7 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  33.42 
 
 
449 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  29.3 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  26.56 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
397 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
420 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  33.53 
 
 
404 aa  106  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  31.51 
 
 
389 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.78 
 
 
414 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  30.05 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  32.44 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  25.75 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  29.31 
 
 
379 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
413 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  28.57 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.33 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  28.33 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  37.58 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.25 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  23.33 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.77 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.84 
 
 
402 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  29.1 
 
 
272 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.65 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  31.51 
 
 
467 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
476 aa  57  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  40.52 
 
 
519 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  34.34 
 
 
492 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  27.24 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.52 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.56 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.45 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  28.22 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
462 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  30.89 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  28.89 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  31.65 
 
 
440 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.19 
 
 
387 aa  53.5  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
515 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.75 
 
 
515 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  24.52 
 
 
461 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  32.03 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.07 
 
 
504 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  31.33 
 
 
397 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.29 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 
498 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 
521 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  30.73 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  31.11 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  31.11 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  27.98 
 
 
466 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
497 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.92 
 
 
410 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>