More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3532 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  758    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  57.54 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  57.54 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  55.76 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  50 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 414 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.25 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  30.12 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.98 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  34.83 
 
 		 530 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 395 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  30.99 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  32.75 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 431 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.72 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  30.54 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  29.24 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  29.94 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  30.16 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02814  MFS lactose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17310)  29.81 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0410012  normal  0.438044 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  24.89 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  27.88 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  24.6 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.26 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  26.01 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.67 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  27.04 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  25.84 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  25.32 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.63 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.22 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  25.69 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.95 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 459 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 462 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 456 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  30.26 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 497 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 503 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 521 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  30.56 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 474 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>