More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1190 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  769    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  57.25 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  57.25 
 
 		 410 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.17 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  29.2 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  27.62 
 
 		 414 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  31.92 
 
 		 530 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  34.67 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  26.93 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0807  multidrug resistance transporter, Bcr family  28.73 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  27.3 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  26.25 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.21 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.88 
 
 		 465 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.01 
 
 		 472 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 529 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  26.69 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  25.19 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  25.19 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  25.19 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  25.19 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  25.19 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  26.36 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.41 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 467 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 496 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 		 587 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 461 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.26 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  25.17 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  24.6 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  26 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  24.59 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 553 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  24.19 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  24.19 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.19 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  24.19 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  32.5 
 
 		 582 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  24.19 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  24.19 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  23.79 
 
 		 475 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>