124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5888 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  765    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  62.27 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  48.13 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 409 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  46.81 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.55 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  32.06 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.06 
 
 		 407 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.01 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  26.49 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  26.35 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  25.14 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 453 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  29.43 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  28.26 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  26.79 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  27.03 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2698  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  32.69 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  29.03 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  29.03 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  29.03 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  29.03 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01070  polyamine transport-related protein, putative  28.67 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.593333  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  29.03 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  27.15 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  27.15 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  28.22 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34.19 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  32.08 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  30.65 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  27.15 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  30.65 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.9 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  27.15 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>