97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2698 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2698  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  771    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  29.02 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  34.75 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  34.75 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  34.17 
 
 		 404 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3316  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 550 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0200557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  35.04 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  35.04 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  34.17 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 		 509 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 465 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 		 484 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  32.5 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  27.76 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  28.69 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02614  plasma membrane hexose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00220)  33.04 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.969205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  34.48 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  34.48 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.07 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 538 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  35.42 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 574 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.97 
 
 		 543 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 508 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.74 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.51 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05800  Drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  43.4 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.95 
 
 		 521 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.59 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 592 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.08 
 
 		 685 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 530 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3389  hypothetical protein  32.73 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 		 525 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 523 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3498  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.8 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 505 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 583 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 528 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 		 607 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1566  major facilitator superfamily protein  50.91 
 
 		 481 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 501 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 512 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14760  sugar phosphate permease  38.33 
 
 		 493 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19609  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 514 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 		 519 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 565 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>