More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3389 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402028 
 
 
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NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  84.48 
 
 		 404 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  68.83 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  65.64 
 
 		 396 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.47 
 
 		 399 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.47 
 
 		 399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.47 
 
 		 399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.9 
 
 		 397 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  65.93 
 
 		 395 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  62.56 
 
 		 395 aa  263  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.19 
 
 		 401 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2449  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.91 
 
 		 410 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  51.9 
 
 		 419 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.87 
 
 		 402 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.95 
 
 		 398 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  34.95 
 
 		 398 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  36.24 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  32.88 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  32.26 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 413 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.88 
 
 		 402 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.71 
 
 		 401 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.97 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.08 
 
 		 400 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.59 
 
 		 411 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.33 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.31 
 
 		 400 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
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NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  36.91 
 
 		 408 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  35.02 
 
 		 397 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.59 
 
 		 411 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.78 
 
 		 405 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.91 
 
 		 400 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.65 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  36.46 
 
 		 400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  37.11 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.84 
 
 		 400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 		 444 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
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NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.36 
 
 		 402 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4704  putative drug resistance transporter  36.55 
 
 		 402 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.096379  normal  0.25889 
 
 
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NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.82 
 
 		 428 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 402 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.02 
 
 		 400 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 402 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 402 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 411 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 402 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
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NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 		 429 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
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NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 402 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 402 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  38.64 
 
 		 411 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.36 
 
 		 402 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.14 
 
 		 411 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.46 
 
 		 416 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.42 
 
 		 405 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 402 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.42 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.86 
 
 		 425 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.19 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.42 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.42 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.38 
 
 		 465 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.76 
 
 		 401 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.38 
 
 		 498 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.45 
 
 		 393 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.96 
 
 		 418 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.21 
 
 		 394 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.76 
 
 		 399 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 405 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.67 
 
 		 426 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  33.94 
 
 		 392 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.15 
 
 		 409 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  39.43 
 
 		 402 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  33.94 
 
 		 392 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.76 
 
 		 418 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.5 
 
 		 411 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  34.97 
 
 		 398 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.49 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.02 
 
 		 386 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.5 
 
 		 411 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.33 
 
 		 426 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 405 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.1 
 
 		 406 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  31.94 
 
 		 402 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.09 
 
 		 430 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 458 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 405 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 411 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 398 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36 
 
 		 440 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.64 
 
 		 411 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  37.14 
 
 		 414 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.58 
 
 		 405 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 412 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  38.04 
 
 		 401 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 422 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
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