241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4324 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  48.47 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  42.78 
 
 		 414 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  42.82 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  34.05 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  35 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  35 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  35 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 404 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.64 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 405 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  33.15 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  37.76 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  29.11 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  31.44 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  30.66 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  28.03 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  27.35 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.7 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.23 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 476 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  24.59 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.36 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  29.95 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  28.15 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.59 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  28.15 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  28.15 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.94 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.94 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  33.94 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.94 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  25.44 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.67 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  27.38 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.46 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.94 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.94 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.34 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.34 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.34 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.94 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>