107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 421 aa  791    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 414 aa  255  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  43.5 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  43.04 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  37.99 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  28.68 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  27.35 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.14 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.28 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  27.91 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  24.81 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 400 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47769  predicted protein  26.25 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  29.57 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  28.62 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  27.58 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  27.45 
 
 		 477 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  29.78 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.79 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  25.84 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.27 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 477 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  30.59 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  29.12 
 
 		 528 aa  46.6  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  28.49 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46251  predicted protein  40 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  30 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.94 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1278  hypothetical protein  31.58 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1277  hypothetical protein  31.58 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.94 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  34.57 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.69 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.97 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.37 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.12 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  26.58 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>