More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47769 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47769  predicted protein  100 
 
 		 522 aa  1048    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23260  predicted protein  62.68 
 
 		 492 aa  586  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  61.05 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  33.92 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.08 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  33.56 
 
 		 447 aa  209  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  33.16 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  33.16 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  32.28 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  31.26 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  30.54 
 
 		 497 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  32.05 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  32.22 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  31.06 
 
 		 468 aa  193  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.13 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  30.37 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  30.95 
 
 		 475 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  31.69 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  31.54 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  33.11 
 
 		 468 aa  187  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.79 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  30.91 
 
 		 480 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  29.16 
 
 		 474 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  30.41 
 
 		 507 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  31.65 
 
 		 482 aa  180  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  29.93 
 
 		 448 aa  180  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  26.6 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29.91 
 
 		 457 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  31.57 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.16 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  29.82 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  31.66 
 
 		 792 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  28.35 
 
 		 480 aa  170  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  28.67 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  30.64 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  29.52 
 
 		 567 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  28.88 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.98 
 
 		 471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  30.51 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  30.91 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  29.25 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  29.03 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  30.02 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  31.02 
 
 		 482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  30.24 
 
 		 480 aa  163  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  27.29 
 
 		 480 aa  163  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  27.38 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  26.67 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.59 
 
 		 459 aa  160  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  28.13 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  30.65 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  29.35 
 
 		 544 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  29.19 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  28.24 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  27.68 
 
 		 475 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  31.19 
 
 		 480 aa  156  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  31.48 
 
 		 493 aa  156  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  27.52 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05104  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07700)  28.03 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0144049  hitchhiker  0.00149978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  27.52 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  29.72 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  27.52 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  27.52 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  27.52 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  27.52 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  25.78 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  27.69 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  28.54 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  29.08 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  28.83 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  28.41 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  25.62 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  26.75 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  26.75 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  26.75 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  26.75 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  26.75 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  29.4 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  28.64 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  27.17 
 
 		 477 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27983  Sugar UpTake (tentative)  29.05 
 
 		 550 aa  150  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  29.75 
 
 		 494 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  28.93 
 
 		 490 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  26.51 
 
 		 465 aa  150  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  29.21 
 
 		 492 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  29.21 
 
 		 492 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  29.21 
 
 		 492 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  28.7 
 
 		 490 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_27984  Sugar UpTake (tentative)  29.05 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  27.59 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  29.38 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64741  sugar transporter protein  28.6 
 
 		 550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  26.75 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  28.24 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  27.73 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  29.63 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2048  sugar transporter  28.6 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  28.35 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  30.69 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  25.3 
 
 		 590 aa  147  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>