More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_27983 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_64741  sugar transporter protein  99.64 
 
 
550 aa  1108    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402333  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_27984  Sugar UpTake (tentative)  99.82 
 
 
550 aa  1112    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66414  hexose transporter  77.72 
 
 
553 aa  868    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.730098  normal  0.0488082 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27983  Sugar UpTake (tentative)  100 
 
 
550 aa  1112    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  40.71 
 
 
584 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03357  Putative monosaccharide sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5F2L5]  42.49 
 
 
550 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.205094  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05860  Putative low affinity glucose transporter MstE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q400D8]  40.4 
 
 
562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0426596 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00260  sugar transporter, putative  38.08 
 
 
542 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  38.25 
 
 
528 aa  335  9e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  38.81 
 
 
527 aa  335  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  36.55 
 
 
534 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  35.79 
 
 
529 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  35.15 
 
 
552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01797  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  35.87 
 
 
512 aa  306  9.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000141005  normal  0.63949 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10891  Putative hexose transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2WBH1]  36.17 
 
 
535 aa  299  9e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148796  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01480  hexose transport-related protein, putative  32.88 
 
 
520 aa  298  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85501  High-affinity glucose transporter  34.96 
 
 
747 aa  296  7e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0464607  normal  0.964846 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  31.86 
 
 
550 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  31.66 
 
 
550 aa  236  7e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  32.95 
 
 
524 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03400  hexose transport-related protein, putative  31.49 
 
 
535 aa  233  7.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  31.34 
 
 
531 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  30.58 
 
 
590 aa  223  8e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  30.35 
 
 
561 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  29.91 
 
 
561 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  30.57 
 
 
536 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09169  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  32.41 
 
 
510 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0950433  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40173  Sugar transporter  33.55 
 
 
468 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  30.02 
 
 
542 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  31.27 
 
 
551 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00060  sugar transporter, putative  30.25 
 
 
555 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  33.75 
 
 
458 aa  208  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  29.86 
 
 
504 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09184  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 
531 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  28.52 
 
 
579 aa  207  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  30.8 
 
 
566 aa  206  8e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
743 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  29.43 
 
 
529 aa  205  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  27.8 
 
 
499 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  28.62 
 
 
595 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.26 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 
512 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02584  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01180)  28.21 
 
 
524 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00250  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14442)  27.86 
 
 
547 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04310  monosaccharide transporter, putative  29.48 
 
 
591 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  34.72 
 
 
480 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  28.96 
 
 
544 aa  200  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36948  high-affinity hexose (glucose) transporter  26.92 
 
 
525 aa  199  7.999999999999999e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.046165  normal  0.598705 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04148  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13080)  30.95 
 
 
548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.900838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  31.74 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01865  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04550)  30.66 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  29.4 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  33.33 
 
 
504 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  29.61 
 
 
466 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  33.12 
 
 
492 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  32.57 
 
 
544 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  31.08 
 
 
472 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.99 
 
 
450 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  30.97 
 
 
471 aa  193  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  33.33 
 
 
477 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00070  monosaccharide transporter, putative  28.04 
 
 
590 aa  193  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  30.21 
 
 
468 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  30.95 
 
 
480 aa  192  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  32.83 
 
 
468 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  31.05 
 
 
448 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  28.65 
 
 
522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  31.65 
 
 
487 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00120  sugar transporter, putative  33.05 
 
 
539 aa  190  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.891292  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09173  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00890)  30.79 
 
 
500 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05200  hexose transport-related protein, putative  29.23 
 
 
535 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  30.15 
 
 
459 aa  186  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  28.22 
 
 
550 aa  186  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  30.02 
 
 
533 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  29.56 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00020  glucose transporter, putative  30.27 
 
 
519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77210  quinate permease  27.56 
 
 
594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.436623  normal  0.677517 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00490  sugar transporter, putative  28.44 
 
 
592 aa  184  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.75075  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06848  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12950)  27.45 
 
 
563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.817086  normal  0.150124 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02958  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06720)  29.09 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.280694 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01540  hexose transport-related protein, putative  27.62 
 
 
557 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  29.76 
 
 
545 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09168  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  28.83 
 
 
543 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.050203  normal  0.0522811 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09295  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 
512 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.970402 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11029  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  29.91 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  31.22 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  31.45 
 
 
486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  30.1 
 
 
475 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  29.08 
 
 
476 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  29.98 
 
 
486 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  27.65 
 
 
507 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  28.14 
 
 
474 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  30.93 
 
 
497 aa  176  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.78 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05050  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12170)  27.88 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00148453  hitchhiker  0.00000000414532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  30.56 
 
 
452 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  29.03 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01940  monosaccharide transporter, putative  27.53 
 
 
599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  29.31 
 
 
438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02100  monosaccharide transporter, putative  27.84 
 
 
510 aa  174  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>