More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23260 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_23260  predicted protein  100 
 
 		 492 aa  987    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47769  predicted protein  62.68 
 
 		 522 aa  620  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  62.64 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  32.75 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.64 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  34.29 
 
 		 480 aa  216  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  34.16 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  31.07 
 
 		 497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  31.51 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  30.1 
 
 		 533 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  31.99 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.11 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  31.19 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  33.77 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  33.77 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  31.77 
 
 		 463 aa  197  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  30.8 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  31.12 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  31.52 
 
 		 475 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  30.79 
 
 		 507 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  31.78 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  29.93 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.37 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  31.25 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  29.65 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  30.61 
 
 		 446 aa  183  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  27.87 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  29.54 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  28.79 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  27.77 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  31.29 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  29.91 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  30.59 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  31.13 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  27.78 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  28.16 
 
 		 476 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  29.61 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  32.42 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  28.08 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  29.84 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  28.73 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  29.98 
 
 		 567 aa  170  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  31.51 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  31.43 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  31.43 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  28.95 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  31.43 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  28.86 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  30.97 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  28.41 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  28.86 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  28.86 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  29.08 
 
 		 464 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  29.08 
 
 		 464 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  29.08 
 
 		 464 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  28.86 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  28.86 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  28.86 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  29.08 
 
 		 464 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  28.86 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  28.86 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  29.08 
 
 		 464 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  29.26 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.36 
 
 		 471 aa  166  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  28.86 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  28.7 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  29.36 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  26.67 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  27.89 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  27.8 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  28.67 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  27.94 
 
 		 458 aa  164  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  30.55 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  29.21 
 
 		 473 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  29.68 
 
 		 493 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  27.75 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  29.61 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  30.62 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  29.05 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  28.9 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  29.57 
 
 		 544 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  27.03 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  28.11 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  29.18 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.42 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  29.52 
 
 		 792 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  30.04 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  28.01 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  25.93 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  25.93 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  25.93 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  25.93 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  29.31 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  28.37 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  25.93 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  28.37 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  28.37 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  28.37 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  28.37 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>