282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 530 aa  1025    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 414 aa  180  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.94 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 410 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  35.55 
 
 		 410 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.96 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 395 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 413 aa  100  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 408 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 409 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.89 
 
 		 410 aa  97.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  28.27 
 
 		 414 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  30.45 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 415 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 397 aa  90.5  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 400 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 431 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  30.45 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  31.87 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 404 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 401 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.75 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 423 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.82 
 
 		 440 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.9 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.9 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  32.62 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  21.45 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.93 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  21.99 
 
 		 399 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  27.65 
 
 		 465 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 390 aa  53.9  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  21.15 
 
 		 407 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 389 aa  53.5  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  20.74 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 516 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  32.14 
 
 		 592 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  27.94 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.76 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.26 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  25.97 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.7 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 584 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.81 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  21.93 
 
 		 381 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 392 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  29.66 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 381 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.54 
 
 		 495 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.66 
 
 		 483 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.81 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 424 aa  50.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 405 aa  50.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 405 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 627 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.28 
 
 		 402 aa  50.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.66 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.81 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>