140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1982 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 397 aa  756    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  31.04 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 409 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  26.85 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.01 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  27.02 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  26.76 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4107  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.22 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.18 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02210  spermine transporter, putative  25.33 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  35.44 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  24.55 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.39 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  31.82 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  33.98 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  31.82 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  31.82 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 		 918 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  24.88 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  34.26 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.43 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  28.16 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  31.25 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  30.14 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  29.45 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.26 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  28.57 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  30.36 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  30.36 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08122  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02700)  29.85 
 
 		 532 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03580  conserved hypothetical protein  32.72 
 
 		 633 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0622174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.31 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>