166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2895 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 414 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  35.98 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.95 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  32.49 
 
 		 414 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  31.27 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  31 
 
 		 530 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  29.43 
 
 		 410 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  36.41 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.82 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.71 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  30 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  29.71 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  29.11 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  29.33 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  31.08 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 272 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.06 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23950  arabinose efflux permease family protein  30.88 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.297919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.08 
 
 		 534 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  33.88 
 
 		 479 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 478 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  34.69 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  34.31 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.57 
 
 		 788 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 480 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 486 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 486 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 486 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>