108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  100 
 
 		 402 aa  749    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.59 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  31.15 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 413 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.7 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.97 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  30.12 
 
 		 530 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  28.65 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  28.21 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 428 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6524  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39358  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6240  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 513 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5542  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 445 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3626  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 445 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0809302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4741  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 445 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1016  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  33.63 
 
 		 535 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 562 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  34.62 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  33.83 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  31.29 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.89 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.61 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 533 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 529 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  40.62 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  31.62 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.4 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 452 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 452 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 514 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 553 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 518 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.54 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  30.66 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>