140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2121 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  45.11 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  45.4 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  44.64 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  40.06 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  33.23 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.54 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.48 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 405 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 412 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  30 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  30.08 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.96 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  28.65 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  26.06 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  27.38 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  28 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  29.19 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  25.25 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  37.23 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  34.45 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  32 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.46 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 532 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.65 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08122  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02700)  40 
 
 		 532 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 416 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 529 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  29.37 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  33.86 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 432 aa  46.6  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 455 aa  46.6  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  32.22 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.46 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.09 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>