199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5329 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  87.06 
 
 
403 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  87.06 
 
 
403 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
398 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  87.06 
 
 
403 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  92.21 
 
 
400 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 
408 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 
412 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  32.97 
 
 
435 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  33.15 
 
 
414 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  33.03 
 
 
410 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  33.03 
 
 
410 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  35.1 
 
 
409 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  32.31 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  35.38 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  32.21 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  32.64 
 
 
395 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  33.03 
 
 
410 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
397 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  37.12 
 
 
449 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
404 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  33.14 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  31.44 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.92 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  32.78 
 
 
402 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  29.38 
 
 
408 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  33.51 
 
 
404 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  29.86 
 
 
413 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
399 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
414 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  30.45 
 
 
530 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
431 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  31.8 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
415 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.26 
 
 
435 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  25.45 
 
 
410 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  25.22 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  26.69 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  29.2 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  27.47 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  25.84 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  25.46 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  23.73 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  31.61 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  27.96 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4043  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
530 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.39 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  24.93 
 
 
423 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  28.57 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28.09 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  28.21 
 
 
591 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  27.91 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.53 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.84 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.42 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  25.71 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.77 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  35.48 
 
 
529 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  28.86 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2698  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840048  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  23.9 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  28.02 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  23.9 
 
 
454 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  28.02 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  29.38 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  34.21 
 
 
426 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 
391 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
410 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
424 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  26.77 
 
 
398 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  28.02 
 
 
395 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 
387 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.26 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>