More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0167 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 426 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 413 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4528  major facilitator superfamily transporter  35.05 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.050595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  32.45 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2695  major facilitator superfamily transporter  31.07 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 412 aa  113  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  30.43 
 
 		 370 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1714  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5331  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.51 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.98 
 
 		 414 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  30.67 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.59 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  26.45 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 416 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  31.04 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  34 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 397 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.47 
 
 		 411 aa  87  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  30.77 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  28.65 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  28.65 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  28.65 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  28.49 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  30.65 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  32.39 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  36.43 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  30.18 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  42 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  42 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  38 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  29.38 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.53 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.97 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.25 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.25 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  28 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25.85 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  26.67 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  29.03 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  33.57 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.78 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49750  MFS family transporter  38.19 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  24.89 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1295  multidrug transporter  27.1 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>