135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2695 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2695  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 437 aa  837    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  65.31 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4528  major facilitator superfamily transporter  58.85 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.050595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  31.69 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5331  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1714  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.2 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.75 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  34.48 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  28.39 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.3 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.3 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  30 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  27.8 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  30.77 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  27.8 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  27.45 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  25.79 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  27.74 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  19.79 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28.08 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  24.02 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.67 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.55 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  29.48 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  29.48 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.81 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.15 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.59 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  25.32 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  23 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.89 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  30.99 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  41.58 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  38.1 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  24.68 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  24.05 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  24.05 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  24.05 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  24.05 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  27.59 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  24.05 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  42.57 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>