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for query gene lpp2900 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  801    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  98.25 
 
 		 399 aa  792    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  26.32 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.07 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.42 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 		 405 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.68 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  25.62 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  29.84 
 
 		 409 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.33 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.68 
 
 		 434 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.05 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.72 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  30 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.07 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.01 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.76 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.26 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.11 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.2 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.53 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.53 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0384  bicyclomycin resistance protein  27.21 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.27 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.27 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.8 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.33 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.27 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.46 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.46 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.77 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.46 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.77 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.71 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.4 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.81 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.73 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0064  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.97 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.834024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  25.54 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.44 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.01 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  25.71 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.89 
 
 		 461 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.63 
 
 		 393 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.36 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  25.61 
 
 		 423 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.07 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  27.07 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.97 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  27.97 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.07 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.21 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.6 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.6 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  24.75 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.5 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2373  inner membrane transport protein YdhC  28.24 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.93 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.93 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.93 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.21 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.82 
 
 		 465 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  25.86 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.79 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.04 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.96 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.22 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.91 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.71 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.73 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.24 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.28 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.18 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  26.99 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.1 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.96 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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